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Die vom Regierungsrat 2015 beschlossene Übergabe neuer Aufgaben in den Bereichen Immobilien und Universitäre Medizin Zürich an die UZH trug wesentlich zur Stärkung der universitären Autonomie bei; gleichzeitig stellte sie hohe Anforderungen an die Führung der UZH insgesamt. Aus diesem Grund wurde die Universitätsleitung per 1. August 2018 neu ausgerichtet: Ergänzt durch die Direktion UMZH sowie die Direktion Immobilien und Betrieb besteht die Universitätsleitung seit dem 1. August 2018 aus sieben Mitgliedern.
Bis 1. August 2020 wurde im Rahmen des Programms Governance 2020+ zudem die bisherige Götti-Funktion der Prorektorinnen und Prorektoren abgebaut und durch neue Aufgaben, Kompetenzen und Verantwortungsbereiche ersetzt. Diese richten sich nach den fakultätsübergreifenden Querschnittsfunktionen der einzelnen UL-Bereiche. So kann die Universitätsleitung ihre Arbeit insgesamt stärker auf die strategische Weiterentwicklung der UZH richten.